环球视点!cDNA和基因组DNA的区别
什么是cDNA
cDNA(互补DNA)是指其碱基序列与DNA互补的合成DNA。它是由RNA模板的逆转录产生的。总RNA,前mRNA,RNA,核糖体RNA或tRNA可用于逆转录。逆转录酶是催化从RNA产生cDNA的反应的酶。逆转录与PCR耦合如图1所示。
(资料图)
图1.逆转录与PCR耦合
cDNA主要用于克隆原核基因组中的真核基因。外显子由蛋白质的编码区组成。在真核生物中,编码区被内含子中断。在转录过程中,内含子和外显子都被编码到前mRNA中。但是在mRNA加工过程中,内含子从mRNA中去除,通过将外显子剪接在一起产生成熟的mRNA。生物体的总mRNA称为转录组。然而,原核生物缺乏mRNA加工机制。因此,mRNA用于合成仅包含基因组蛋白质编码区域的cDNA。这种cDNA用于将基因克隆成原核生物。cDNA在逆转录病毒中在RNA基因组转化为DNA的过程中自然产生。
什么是基因组基因
基因组DNA(gDNA)是指基因组中染色体DNA的集合。特定生物体的全部基因集被称为其基因组。然而,不仅基因组的基因是活跃的。大多数生物群在群体内具有相似类型的基因组DNA。生物体的基因组从下一代传给另一代。通常,基因组由大量碱基对组成。例如,人类基因组由大约30亿个碱基对组成。人类基因组的染色体如图2所示。
图2.人类基因组的染色体
在基因组DNA中发现的四种类型的序列是蛋白质编码基因,串联重复基因,重复DNA和间隔DNA。基因组DNA用于分子生物学的许多实验。与cDNA的制备相比,基因组DNA的分离很容易。基因组 DNA 可用作 PCR 模板,用于克隆、测序、制备基因组文库、DNA 指纹图谱、研究基因结构和检测突变/异常。
cDNA和基因组DNA的区别
定义
cDNA:cDNA是合成DNA,其碱基序列与基因组DNA互补。
基因组DNA:基因组DNA是基因组中染色体DNA的全套。
代表
cDNA:cDNA代表转录组。
基因组DNA:DNA代表基因组。
合成/提取自
cDNA:cDNA是由不同类型RNA的逆转录合成的。
基因组DNA:基因组DNA可以从现有基因组中提取。
内容
cDNA:cDNA由外显子或编码区组成。
基因组DNA:基因组DNA由生物体的编码和非编码序列组成。
数量
cDNA:cDNA包含一些碱基对。
基因组DNA:基因组DNA包含大量碱基对。
应用
cDNA:cDNA用于产生cDNA文库。
基因组DNA:基因组DNA可用于产生基因组文库。
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