来自纽约大学阿布扎比分校基因组学和系统生物学中心的研究团队,近日成功对 2000 多年前已经灭绝的枣椰树(Phoenix dactylifera L.)进行基因组测序。团队从黎凡特南部地区的考古遗址中找到的枣椰树种子进行了测序,这些种子的放射性碳化时间为公元前 4 世纪至公元 2 世纪。
这些种子经过发芽,产生了可行的新植物。研究人员对这些发芽的古代样本进行了全基因组测序,并利用这些基因组数据来研究这些以前已经灭绝的犹太枣椰树(Judean date palms)的遗传学。这项研究标志着研究人员首次对古代发芽种子的植物基因组进行测序。
通过检查几个世纪前繁荣的物种(Phoenix dactylifera L.)的基因组,生物学教授 Michael D. Purugganan 和他纽约大学的同事,以及以色列和法国的研究伙伴,能够看到这些植物在一段时间内是如何进化的。
在这种情况下,他们观察到,在公元前4世纪和公元2世纪之间,地中海东部的枣树开始显示出来自另一个物种--Phoenix theophrasti(目前生长在克里特岛和一些希腊岛屿的枣椰树)越来越多的基因。他们的结论是,在这一时期来自 P. theophrasti 的基因水平不断提高,表明罗马帝国在地中海东部的影响越来越大。
Purugganan 表示:“我们很幸运,枣树种子可以活很久--在这种情况下,超过2000年--并且在该地区的干燥环境中以最小的DNA损伤发芽。通过复活生物材料,如来自考古、古生物遗址或历史收藏品的发芽的古代种子,我们不仅可以研究失落种群的基因组,而且在某些情况下,还可以重新发现现代品种中可能已经灭绝的基因”。